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1934年
1934年，江苏省立医政学院在镇江北固山麓建立。
1937年
因抗战形势，1937年11月，学校西迁。
1938年
因抗战形势，1937年11月，学校西迁，1938年，更名为国立江苏医学院，经两湖、再贵阳，终在重庆北碚复校。
1949年
1946年9月，学校从重庆北碚迁回镇江原址复校。1949年4月，镇江解放，学校更名江苏医学院。
1957年
1957年，江苏医学院由镇江迁址南京办学，同年更名为南京医学院。
1970年
1970年，学校与南京中医学院合并成为江苏新医学院。
1978年
1978年，江苏新医学院原南京医学院部分改建为（恢复）南京医学院，其主体后来发展成为南京医科大学。
1993年
1993年12月3日，原国家教委正式批准学校更名为南京医科大学。
2003年
2003年，南京医科大学江宁校区正式启用。
2015年
2015年9月21日，江苏省人民政府、原国家卫生计生委、教育部联合发文，决定共建南京医科大学，学校正式列入部委省共建高校，同年11月，学校召开部委省共建动员大会。
2017年
2017年，南京医科大学入选江苏高水平大学建设行列。图为学校召开学科建设暨江苏高水平大学建设工作推进会。
2021年
2021年，南京医科大学入选江苏高水平大学建设高峰计划（A类）。
2022年
2022年，南京医科大学入选国家“双一流”建设高校、公共卫生与预防医学入选“双一流”建设学科。
2022年
2022年，南京医科大学入选教育部高水平公共卫生学院建设高校。
